高卢村庄的大祭祀盖塔菲克斯想为自己找一个继任者，并把高卢村庄抵抗外敌入侵的关键法宝神奇药水教给继任者。盖塔菲克斯带着村庄最英勇的战士阿斯特克斯和奥贝里克斯寻访遍历整个高卢寻找合适的继承人。 而与此同时，师出同门的硫磺克斯在消失多年后和入侵者狼狈为奸，暗中掀起一场争夺神奇药水的战争。

这一季延续了前作的故事。所有变形金刚的火种都来自于矩阵，当他们死亡时，火种会回归矩阵，记忆也会伴随火种一起回归，矩阵会把这些记忆分解成数据进行分析，在分析中不断进行自我学习，最终实现系统的升级换代。擎天柱摧毁了他的世界，他必须在矩阵发生之前面对后果。巨无霸在击败巨狰狞后返回赛博坦星球，却发现所有居民的火种都被囚禁。擎天柱、黄豹和黑寡妇被迫变回兽形态，并失去了大部分记忆。他们在地下发现了核心电脑，那是一种超级计算机，从中可以获得新的科技有机体形态。巨无霸必须解放被囚禁的火种，帮助同伴银箭和犀牛解开自己的命运

巨无霸是一支由机器野兽组成的凶猛队伍，他们由汽车人进化而来，肩负保卫家园免受邪恶威震天侵害的任务。第一季讲述了巨无霸在他们的家园赛博坦星球上由昏迷转醒，却发现自己被威震天创造的无意识武装兽和新一代变形金刚追捕。巨无霸被迫进入地下，他们的野兽和机器人身体发生了奇怪的变化。巨无霸必须解放赛博坦星球，恢复其原本的有机生命形式。在这一季中，擎天柱、黄豹和黑寡妇等角色经历了重重挑战，逐步掌握了新的身体形态，并与威震天展开激烈对抗，试图拯救他们的星球。巨无霸们逐渐了解了他们新的变形能力的优势，开始团结起来推翻威震天的